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土壤中的有機質能顯著改善土壤的理化性狀，使土壤耕性變好，滲水能力增強，提高土壤蓄水、保肥、供肥和抗旱防澇能力，增產明顯，這是化肥不能替代的。增加土壤有機質的方法主要是增施有機肥，包括人畜糞尿、土雜肥、秸稈、商品有機肥等。在過去傳統農業生產中，有機肥發揮了重要作用。隨著現代工業發展，化肥的施用亦越來越廣泛，具有施用簡便、速效和高產的特點，為農業生產發展做出了重大貢獻。但如果不遵循“以有機肥為主，化肥為輔”的施肥原則，長期單一、大量使用化肥，易造成土壤板結，地力下降，土質酸化嚴重，反而會制約作物產量，影響產品品質。農業現代化的不斷發展，有機肥在農業生產中的作用重新受到重視，用有機肥種出的農產品口感佳，能夠有效保持瓜果蔬菜等本身特有的營養和味道。有機肥料不僅可以阻止生態環境的惡化，提高環境質量，而且在農業生產方面也發揮著巨大的作用。有機肥料對農業生產做出了以下貢獻：
1.提高土壤的培肥地力作用:
土壤中的微量元素95%以不溶態形式存在，不能被植物吸收利用，而微生物代謝產物中含有大量的有機酸類物質，這些物質就像在冰塊中加入的熱水一樣，很快就能把微量元素如鈣、鎂、硫、銅、鋅、鐵、硼、鉬等植物必需的礦物元素溶解，變成可以被植物直接吸收利用的營養元素，大大增加了土壤的供肥能力。有機肥料中的有機質增加了土壤中的有機質含量，使得土壤粘結度降低，砂性土壤保水保肥性能變強，從而土壤形成穩定的團粒結構，便可以發揮良好的肥力協調供應能力。用過有機肥，土壤會變得疏松、肥沃。
2.提高土壤質量，促進土壤微生物繁殖:
有機肥料可以使土壤中的微生物大量繁殖，特別是許多有益的微生物，如固氮菌、氨化菌、纖維素分解菌等。.這些有益微生物，能分解土壤中的有機物，增加土壤的團粒結構，改善土壤組成。微生物在土壤中的繁殖速度非常快，他們就像一張看不見的大網，錯綜復雜。微生物的菌體死亡后，在土壤中留下了很多微細的管道，這些微細的管道不但增加了土壤的透氣性，而且還使土壤變得蓬松柔軟，養分水分不易流失，增加了土壤蓄水蓄肥能力，避免和消除了土壤的板結。有機肥中的有益微生物還能抑制有害病菌的繁殖，這樣就可以做到少打藥，如果連續多年施用，可以有效抑制土壤有害生物，省工、省錢、無污染。同時，有機肥料中有動物消化道分泌的各種活性酶，以及微生物產生的各種酶。這些物質施到土壤后，可大大提高土壤的酶活性。長期持久使用有機肥可以改善土壤的質量。從根本上改善提高了土壤的質量，就不怕種不出優質的果實。
